A partir da versão 2009 do MSN Messenger (Windows Live Messenger 2009) é possível abrir duas ou mais instâncias ao mesmo tempo do comunicador instantâneo.
Essa opção não está habilitada por padrão após a instalação do Windows Live Messenger 2009, para ativar essa opção é preciso fazer algumas alterações no registro do Windows. Segue:
1) Vá no Menu Iniciar > Executar (tecla de atalho: Windows + R), digite regedit e dê Enter. Você abrirá o registro do Windows.
2) Se o seu Windows é de 32 bits, vá para a seguinte chave:
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows Live\Messenger
Caso ele seja de 64 bits, vá para a seguinte chave do registro:
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Wow6432Node\Microsoft\Windows Live\Messenger
3) No painel direito, clique com o botão direito em qualquer espaço em branco e selecione a opção Novo > Valor DWORD.
4) Renomeie essa nova entrada para MultipleInstances. Dê dois cliques nessa entrada e no campo Dados do valor, insira o número 1.
5) Feche o editor de registro e Windows Live Messenger. Agora já poderá abrir vários Windows Live Messengers ao mesmo tempo.
Com informações: Tecnoblog